Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms