Protein–RNA interactions for Protein: P80075

CCL8, C-C motif chemokine 8, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL8P80075 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL8P80075 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL8P80075 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL8P80075 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL8P80075 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL8P80075 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL8P80075 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL8P80075 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL8P80075 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL8P80075 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL8P80075 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL8P80075 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL8P80075 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL8P80075 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL8P80075 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL8P80075 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL8P80075 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL8P80075 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL8P80075 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL8P80075 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL8P80075 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCL8P80075 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCL8P80075 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCL8P80075 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCL8P80075 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCL8P80075 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCL8P80075 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL8P80075 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL8P80075 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL8P80075 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL8P80075 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL8P80075 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL8P80075 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL8P80075 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL8P80075 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL8P80075 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL8P80075 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL8P80075 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL8P80075 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL8P80075 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL8P80075 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL8P80075 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL8P80075 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL8P80075 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL8P80075 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL8P80075 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL8P80075 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL8P80075 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL8P80075 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL8P80075 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL8P80075 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL8P80075 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL8P80075 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL8P80075 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL8P80075 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL8P80075 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL8P80075 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL8P80075 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL8P80075 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL8P80075 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL8P80075 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL8P80075 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL8P80075 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL8P80075 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL8P80075 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL8P80075 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL8P80075 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL8P80075 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL8P80075 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL8P80075 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL8P80075 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL8P80075 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL8P80075 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL8P80075 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL8P80075 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL8P80075 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL8P80075 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL8P80075 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL8P80075 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL8P80075 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL8P80075 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL8P80075 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL8P80075 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL8P80075 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL8P80075 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL8P80075 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL8P80075 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL8P80075 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL8P80075 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL8P80075 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL8P80075 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL8P80075 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL8P80075 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL8P80075 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL8P80075 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL8P80075 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL8P80075 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL8P80075 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL8P80075 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL8P80075 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms