Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRX6P78412 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRX6P78412 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRX6P78412 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRX6P78412 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRX6P78412 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRX6P78412 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRX6P78412 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRX6P78412 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRX6P78412 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
IRX6P78412 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRX6P78412 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRX6P78412 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRX6P78412 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRX6P78412 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRX6P78412 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRX6P78412 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRX6P78412 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRX6P78412 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRX6P78412 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRX6P78412 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRX6P78412 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRX6P78412 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRX6P78412 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRX6P78412 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRX6P78412 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
IRX6P78412 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
IRX6P78412 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRX6P78412 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRX6P78412 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRX6P78412 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRX6P78412 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRX6P78412 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
IRX6P78412 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRX6P78412 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRX6P78412 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRX6P78412 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRX6P78412 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRX6P78412 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRX6P78412 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRX6P78412 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRX6P78412 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRX6P78412 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
IRX6P78412 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRX6P78412 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRX6P78412 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRX6P78412 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRX6P78412 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRX6P78412 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRX6P78412 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRX6P78412 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRX6P78412 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRX6P78412 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRX6P78412 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRX6P78412 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRX6P78412 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRX6P78412 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRX6P78412 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRX6P78412 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRX6P78412 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRX6P78412 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRX6P78412 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRX6P78412 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRX6P78412 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRX6P78412 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRX6P78412 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRX6P78412 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRX6P78412 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
IRX6P78412 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRX6P78412 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRX6P78412 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRX6P78412 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRX6P78412 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRX6P78412 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRX6P78412 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRX6P78412 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRX6P78412 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRX6P78412 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRX6P78412 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRX6P78412 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRX6P78412 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRX6P78412 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IRX6P78412 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IRX6P78412 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IRX6P78412 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IRX6P78412 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IRX6P78412 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IRX6P78412 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IRX6P78412 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IRX6P78412 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IRX6P78412 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IRX6P78412 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IRX6P78412 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IRX6P78412 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
IRX6P78412 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IRX6P78412 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IRX6P78412 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IRX6P78412 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IRX6P78412 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IRX6P78412 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms