Protein–RNA interactions for Protein: P61576

HERV-K104, Endogenous retrovirus group K member 104 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERV-K104P61576 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms