Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms