Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms