Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms