Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
AFDNP55196 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AFDNP55196 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AFDNP55196 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AFDNP55196 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AFDNP55196 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AFDNP55196 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AFDNP55196 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AFDNP55196 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AFDNP55196 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AFDNP55196 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AFDNP55196 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AFDNP55196 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AFDNP55196 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AFDNP55196 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AFDNP55196 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AFDNP55196 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AFDNP55196 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AFDNP55196 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AFDNP55196 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AFDNP55196 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AFDNP55196 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AFDNP55196 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AFDNP55196 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AFDNP55196 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AFDNP55196 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AFDNP55196 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AFDNP55196 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AFDNP55196 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AFDNP55196 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AFDNP55196 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
AFDNP55196 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AFDNP55196 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
AFDNP55196 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
AFDNP55196 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AFDNP55196 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AFDNP55196 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AFDNP55196 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AFDNP55196 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AFDNP55196 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AFDNP55196 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AFDNP55196 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AFDNP55196 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AFDNP55196 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AFDNP55196 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AFDNP55196 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AFDNP55196 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AFDNP55196 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AFDNP55196 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AFDNP55196 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AFDNP55196 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AFDNP55196 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
AFDNP55196 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AFDNP55196 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AFDNP55196 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
AFDNP55196 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AFDNP55196 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AFDNP55196 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AFDNP55196 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AFDNP55196 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AFDNP55196 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AFDNP55196 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AFDNP55196 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AFDNP55196 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AFDNP55196 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
AFDNP55196 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
AFDNP55196 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AFDNP55196 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AFDNP55196 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AFDNP55196 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AFDNP55196 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
AFDNP55196 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AFDNP55196 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AFDNP55196 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AFDNP55196 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AFDNP55196 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AFDNP55196 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AFDNP55196 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AFDNP55196 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
AFDNP55196 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AFDNP55196 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AFDNP55196 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AFDNP55196 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AFDNP55196 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AFDNP55196 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AFDNP55196 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AFDNP55196 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AFDNP55196 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AFDNP55196 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AFDNP55196 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AFDNP55196 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AFDNP55196 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AFDNP55196 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AFDNP55196 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AFDNP55196 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AFDNP55196 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AFDNP55196 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AFDNP55196 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AFDNP55196 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AFDNP55196 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms