Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA8P53708 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms