Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP98P52948 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP98P52948 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP98P52948 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP98P52948 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP98P52948 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP98P52948 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP98P52948 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP98P52948 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP98P52948 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP98P52948 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP98P52948 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP98P52948 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP98P52948 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP98P52948 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP98P52948 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP98P52948 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP98P52948 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP98P52948 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP98P52948 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP98P52948 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP98P52948 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP98P52948 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP98P52948 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP98P52948 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP98P52948 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP98P52948 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP98P52948 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP98P52948 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP98P52948 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP98P52948 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP98P52948 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP98P52948 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP98P52948 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP98P52948 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP98P52948 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP98P52948 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP98P52948 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NUP98P52948 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NUP98P52948 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NUP98P52948 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NUP98P52948 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NUP98P52948 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP98P52948 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP98P52948 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP98P52948 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP98P52948 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP98P52948 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP98P52948 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP98P52948 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP98P52948 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP98P52948 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP98P52948 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP98P52948 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP98P52948 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP98P52948 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP98P52948 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP98P52948 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP98P52948 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP98P52948 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP98P52948 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP98P52948 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP98P52948 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP98P52948 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP98P52948 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP98P52948 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP98P52948 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP98P52948 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP98P52948 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP98P52948 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP98P52948 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP98P52948 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP98P52948 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP98P52948 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP98P52948 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP98P52948 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP98P52948 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP98P52948 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP98P52948 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP98P52948 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP98P52948 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP98P52948 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP98P52948 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP98P52948 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP98P52948 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP98P52948 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP98P52948 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP98P52948 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP98P52948 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP98P52948 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP98P52948 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP98P52948 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP98P52948 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP98P52948 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP98P52948 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP98P52948 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP98P52948 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP98P52948 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP98P52948 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP98P52948 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms