Protein–RNA interactions for Protein: P49447

CYB561, Cytochrome b561, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYB561P49447 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYB561P49447 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYB561P49447 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYB561P49447 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYB561P49447 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYB561P49447 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYB561P49447 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYB561P49447 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYB561P49447 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYB561P49447 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYB561P49447 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYB561P49447 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYB561P49447 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYB561P49447 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYB561P49447 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYB561P49447 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYB561P49447 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYB561P49447 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYB561P49447 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYB561P49447 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYB561P49447 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYB561P49447 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYB561P49447 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CYB561P49447 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYB561P49447 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYB561P49447 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYB561P49447 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYB561P49447 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYB561P49447 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYB561P49447 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYB561P49447 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CYB561P49447 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYB561P49447 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CYB561P49447 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYB561P49447 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYB561P49447 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYB561P49447 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYB561P49447 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYB561P49447 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYB561P49447 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYB561P49447 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYB561P49447 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYB561P49447 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CYB561P49447 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CYB561P49447 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYB561P49447 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYB561P49447 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYB561P49447 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYB561P49447 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYB561P49447 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYB561P49447 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYB561P49447 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYB561P49447 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYB561P49447 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYB561P49447 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYB561P49447 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYB561P49447 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYB561P49447 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYB561P49447 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYB561P49447 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYB561P49447 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYB561P49447 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYB561P49447 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYB561P49447 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYB561P49447 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYB561P49447 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYB561P49447 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYB561P49447 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYB561P49447 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYB561P49447 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYB561P49447 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CYB561P49447 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYB561P49447 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYB561P49447 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CYB561P49447 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CYB561P49447 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYB561P49447 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYB561P49447 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYB561P49447 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYB561P49447 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYB561P49447 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYB561P49447 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYB561P49447 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYB561P49447 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYB561P49447 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYB561P49447 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYB561P49447 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYB561P49447 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYB561P49447 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYB561P49447 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYB561P49447 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYB561P49447 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYB561P49447 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYB561P49447 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYB561P49447 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYB561P49447 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYB561P49447 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYB561P49447 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYB561P49447 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYB561P49447 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms