Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNTBP49356 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNTBP49356 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNTBP49356 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNTBP49356 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNTBP49356 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNTBP49356 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNTBP49356 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNTBP49356 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNTBP49356 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNTBP49356 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FNTBP49356 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNTBP49356 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNTBP49356 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNTBP49356 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNTBP49356 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNTBP49356 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNTBP49356 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNTBP49356 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNTBP49356 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNTBP49356 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNTBP49356 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNTBP49356 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNTBP49356 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNTBP49356 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNTBP49356 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNTBP49356 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNTBP49356 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNTBP49356 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNTBP49356 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNTBP49356 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNTBP49356 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FNTBP49356 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNTBP49356 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNTBP49356 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNTBP49356 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNTBP49356 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNTBP49356 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FNTBP49356 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNTBP49356 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNTBP49356 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNTBP49356 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNTBP49356 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNTBP49356 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNTBP49356 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNTBP49356 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNTBP49356 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNTBP49356 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNTBP49356 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNTBP49356 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNTBP49356 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNTBP49356 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNTBP49356 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNTBP49356 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNTBP49356 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNTBP49356 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNTBP49356 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNTBP49356 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNTBP49356 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNTBP49356 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNTBP49356 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNTBP49356 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNTBP49356 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNTBP49356 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNTBP49356 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNTBP49356 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNTBP49356 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FNTBP49356 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNTBP49356 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FNTBP49356 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FNTBP49356 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNTBP49356 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNTBP49356 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNTBP49356 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNTBP49356 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNTBP49356 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNTBP49356 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNTBP49356 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNTBP49356 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FNTBP49356 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FNTBP49356 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FNTBP49356 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FNTBP49356 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FNTBP49356 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FNTBP49356 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FNTBP49356 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FNTBP49356 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FNTBP49356 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FNTBP49356 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNTBP49356 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNTBP49356 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNTBP49356 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNTBP49356 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNTBP49356 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNTBP49356 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNTBP49356 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNTBP49356 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNTBP49356 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNTBP49356 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNTBP49356 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms