Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK8P49336 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK8P49336 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK8P49336 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK8P49336 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK8P49336 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK8P49336 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK8P49336 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK8P49336 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK8P49336 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK8P49336 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK8P49336 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK8P49336 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK8P49336 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK8P49336 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK8P49336 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK8P49336 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK8P49336 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK8P49336 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK8P49336 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK8P49336 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK8P49336 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK8P49336 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK8P49336 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK8P49336 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK8P49336 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK8P49336 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK8P49336 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK8P49336 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK8P49336 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK8P49336 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK8P49336 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK8P49336 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK8P49336 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK8P49336 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK8P49336 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK8P49336 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CDK8P49336 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CDK8P49336 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
CDK8P49336 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK8P49336 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK8P49336 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK8P49336 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK8P49336 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK8P49336 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK8P49336 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK8P49336 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK8P49336 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK8P49336 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK8P49336 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK8P49336 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK8P49336 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK8P49336 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK8P49336 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK8P49336 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK8P49336 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK8P49336 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK8P49336 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK8P49336 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK8P49336 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK8P49336 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK8P49336 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK8P49336 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK8P49336 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK8P49336 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK8P49336 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK8P49336 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK8P49336 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK8P49336 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK8P49336 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK8P49336 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK8P49336 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK8P49336 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK8P49336 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK8P49336 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK8P49336 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK8P49336 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK8P49336 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK8P49336 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK8P49336 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK8P49336 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK8P49336 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK8P49336 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK8P49336 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK8P49336 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK8P49336 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK8P49336 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK8P49336 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK8P49336 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK8P49336 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK8P49336 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK8P49336 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK8P49336 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK8P49336 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK8P49336 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK8P49336 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK8P49336 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK8P49336 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK8P49336 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK8P49336 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms