Protein–RNA interactions for Protein: P49189

ALDH9A1, 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH9A1P49189 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALDH9A1P49189 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms