Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms