Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIP4K2AP48426 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIP4K2AP48426 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIP4K2AP48426 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIP4K2AP48426 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIP4K2AP48426 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PIP4K2AP48426 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIP4K2AP48426 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PIP4K2AP48426 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIP4K2AP48426 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PIP4K2AP48426 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIP4K2AP48426 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIP4K2AP48426 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIP4K2AP48426 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PIP4K2AP48426 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIP4K2AP48426 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PIP4K2AP48426 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIP4K2AP48426 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIP4K2AP48426 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIP4K2AP48426 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIP4K2AP48426 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIP4K2AP48426 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIP4K2AP48426 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIP4K2AP48426 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIP4K2AP48426 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIP4K2AP48426 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIP4K2AP48426 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIP4K2AP48426 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIP4K2AP48426 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIP4K2AP48426 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIP4K2AP48426 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIP4K2AP48426 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIP4K2AP48426 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIP4K2AP48426 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIP4K2AP48426 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIP4K2AP48426 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PIP4K2AP48426 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PIP4K2AP48426 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIP4K2AP48426 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIP4K2AP48426 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms