Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA4P43681 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms