Protein–RNA interactions for Protein: P43146

DCC, Netrin receptor DCC, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCCP43146 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DCCP43146 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DCCP43146 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DCCP43146 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DCCP43146 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
DCCP43146 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DCCP43146 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DCCP43146 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DCCP43146 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
DCCP43146 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
DCCP43146 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DCCP43146 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DCCP43146 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DCCP43146 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DCCP43146 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DCCP43146 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DCCP43146 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DCCP43146 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DCCP43146 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCCP43146 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCCP43146 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCCP43146 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCCP43146 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCCP43146 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCCP43146 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCCP43146 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCCP43146 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCCP43146 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCCP43146 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
DCCP43146 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCCP43146 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCCP43146 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCCP43146 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCCP43146 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCCP43146 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCCP43146 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCCP43146 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DCCP43146 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DCCP43146 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DCCP43146 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DCCP43146 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DCCP43146 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DCCP43146 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DCCP43146 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
DCCP43146 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DCCP43146 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DCCP43146 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
DCCP43146 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DCCP43146 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DCCP43146 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DCCP43146 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DCCP43146 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DCCP43146 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
DCCP43146 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DCCP43146 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DCCP43146 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DCCP43146 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DCCP43146 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DCCP43146 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DCCP43146 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
DCCP43146 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DCCP43146 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DCCP43146 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DCCP43146 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DCCP43146 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
DCCP43146 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DCCP43146 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
DCCP43146 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DCCP43146 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DCCP43146 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DCCP43146 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DCCP43146 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DCCP43146 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DCCP43146 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DCCP43146 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DCCP43146 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
DCCP43146 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCCP43146 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCCP43146 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
DCCP43146 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCCP43146 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCCP43146 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCCP43146 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCCP43146 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
DCCP43146 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCCP43146 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCCP43146 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCCP43146 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCCP43146 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCCP43146 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCCP43146 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCCP43146 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCCP43146 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCCP43146 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCCP43146 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCCP43146 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCCP43146 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DCCP43146 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DCCP43146 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
DCCP43146 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms