Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GDF5P43026 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GDF5P43026 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GDF5P43026 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GDF5P43026 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GDF5P43026 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GDF5P43026 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GDF5P43026 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GDF5P43026 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GDF5P43026 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GDF5P43026 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GDF5P43026 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GDF5P43026 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GDF5P43026 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GDF5P43026 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GDF5P43026 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GDF5P43026 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GDF5P43026 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GDF5P43026 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GDF5P43026 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GDF5P43026 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GDF5P43026 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GDF5P43026 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GDF5P43026 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GDF5P43026 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GDF5P43026 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GDF5P43026 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GDF5P43026 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GDF5P43026 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GDF5P43026 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GDF5P43026 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GDF5P43026 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GDF5P43026 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GDF5P43026 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GDF5P43026 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GDF5P43026 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GDF5P43026 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GDF5P43026 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GDF5P43026 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GDF5P43026 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GDF5P43026 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GDF5P43026 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GDF5P43026 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GDF5P43026 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GDF5P43026 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GDF5P43026 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GDF5P43026 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GDF5P43026 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GDF5P43026 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GDF5P43026 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GDF5P43026 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GDF5P43026 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GDF5P43026 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GDF5P43026 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GDF5P43026 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GDF5P43026 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GDF5P43026 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GDF5P43026 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GDF5P43026 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GDF5P43026 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GDF5P43026 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GDF5P43026 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GDF5P43026 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GDF5P43026 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GDF5P43026 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GDF5P43026 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GDF5P43026 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GDF5P43026 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GDF5P43026 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GDF5P43026 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GDF5P43026 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GDF5P43026 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GDF5P43026 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GDF5P43026 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GDF5P43026 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GDF5P43026 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GDF5P43026 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GDF5P43026 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GDF5P43026 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GDF5P43026 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GDF5P43026 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GDF5P43026 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GDF5P43026 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GDF5P43026 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GDF5P43026 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GDF5P43026 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GDF5P43026 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GDF5P43026 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GDF5P43026 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GDF5P43026 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GDF5P43026 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GDF5P43026 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GDF5P43026 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GDF5P43026 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GDF5P43026 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GDF5P43026 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GDF5P43026 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GDF5P43026 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GDF5P43026 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GDF5P43026 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms