Protein–RNA interactions for Protein: P40306

PSMB10, Proteasome subunit beta type-10, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB10P40306 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB10P40306 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms