Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJC1P36383 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJC1P36383 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJC1P36383 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJC1P36383 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJC1P36383 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJC1P36383 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJC1P36383 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJC1P36383 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJC1P36383 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJC1P36383 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJC1P36383 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJC1P36383 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJC1P36383 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJC1P36383 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJC1P36383 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJC1P36383 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJC1P36383 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJC1P36383 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJC1P36383 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJC1P36383 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJC1P36383 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJC1P36383 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJC1P36383 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJC1P36383 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GJC1P36383 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GJC1P36383 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJC1P36383 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJC1P36383 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJC1P36383 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJC1P36383 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJC1P36383 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJC1P36383 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJC1P36383 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJC1P36383 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJC1P36383 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJC1P36383 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJC1P36383 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GJC1P36383 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJC1P36383 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJC1P36383 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJC1P36383 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJC1P36383 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJC1P36383 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJC1P36383 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJC1P36383 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJC1P36383 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJC1P36383 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJC1P36383 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJC1P36383 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJC1P36383 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJC1P36383 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJC1P36383 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJC1P36383 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJC1P36383 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GJC1P36383 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJC1P36383 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GJC1P36383 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJC1P36383 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJC1P36383 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJC1P36383 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJC1P36383 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJC1P36383 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJC1P36383 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJC1P36383 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJC1P36383 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJC1P36383 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJC1P36383 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJC1P36383 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJC1P36383 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJC1P36383 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJC1P36383 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GJC1P36383 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJC1P36383 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJC1P36383 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJC1P36383 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJC1P36383 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJC1P36383 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJC1P36383 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJC1P36383 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJC1P36383 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GJC1P36383 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJC1P36383 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJC1P36383 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJC1P36383 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJC1P36383 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJC1P36383 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJC1P36383 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJC1P36383 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJC1P36383 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJC1P36383 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJC1P36383 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJC1P36383 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJC1P36383 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJC1P36383 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJC1P36383 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJC1P36383 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJC1P36383 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJC1P36383 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJC1P36383 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms