Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms