Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CPS1P31327 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CPS1P31327 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CPS1P31327 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CPS1P31327 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CPS1P31327 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CPS1P31327 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CPS1P31327 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CPS1P31327 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CPS1P31327 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CPS1P31327 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CPS1P31327 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CPS1P31327 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CPS1P31327 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CPS1P31327 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CPS1P31327 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CPS1P31327 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CPS1P31327 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CPS1P31327 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CPS1P31327 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CPS1P31327 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CPS1P31327 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CPS1P31327 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CPS1P31327 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CPS1P31327 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CPS1P31327 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CPS1P31327 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CPS1P31327 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CPS1P31327 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CPS1P31327 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CPS1P31327 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CPS1P31327 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CPS1P31327 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CPS1P31327 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CPS1P31327 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CPS1P31327 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CPS1P31327 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CPS1P31327 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CPS1P31327 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CPS1P31327 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CPS1P31327 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CPS1P31327 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CPS1P31327 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CPS1P31327 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CPS1P31327 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CPS1P31327 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CPS1P31327 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CPS1P31327 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CPS1P31327 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CPS1P31327 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CPS1P31327 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CPS1P31327 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CPS1P31327 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CPS1P31327 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CPS1P31327 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CPS1P31327 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CPS1P31327 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CPS1P31327 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CPS1P31327 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CPS1P31327 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CPS1P31327 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CPS1P31327 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CPS1P31327 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CPS1P31327 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CPS1P31327 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CPS1P31327 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CPS1P31327 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CPS1P31327 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPS1P31327 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPS1P31327 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPS1P31327 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CPS1P31327 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPS1P31327 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPS1P31327 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CPS1P31327 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPS1P31327 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPS1P31327 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPS1P31327 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CPS1P31327 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPS1P31327 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CPS1P31327 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPS1P31327 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPS1P31327 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPS1P31327 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPS1P31327 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPS1P31327 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPS1P31327 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPS1P31327 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPS1P31327 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPS1P31327 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPS1P31327 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPS1P31327 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPS1P31327 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPS1P31327 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CPS1P31327 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CPS1P31327 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPS1P31327 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPS1P31327 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CPS1P31327 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPS1P31327 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms