Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms