Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms