Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms