Protein–RNA interactions for Protein: P24385

CCND1, G1/S-specific cyclin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND1P24385 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCND1P24385 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCND1P24385 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCND1P24385 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCND1P24385 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCND1P24385 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCND1P24385 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCND1P24385 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCND1P24385 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCND1P24385 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCND1P24385 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCND1P24385 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCND1P24385 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCND1P24385 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCND1P24385 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCND1P24385 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCND1P24385 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCND1P24385 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCND1P24385 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCND1P24385 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCND1P24385 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCND1P24385 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCND1P24385 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCND1P24385 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCND1P24385 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCND1P24385 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCND1P24385 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCND1P24385 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCND1P24385 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCND1P24385 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCND1P24385 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCND1P24385 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCND1P24385 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCND1P24385 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCND1P24385 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCND1P24385 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCND1P24385 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCND1P24385 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCND1P24385 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCND1P24385 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCND1P24385 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCND1P24385 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCND1P24385 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCND1P24385 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCND1P24385 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCND1P24385 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCND1P24385 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCND1P24385 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCND1P24385 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCND1P24385 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCND1P24385 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCND1P24385 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCND1P24385 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCND1P24385 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCND1P24385 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCND1P24385 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCND1P24385 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCND1P24385 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCND1P24385 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCND1P24385 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCND1P24385 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCND1P24385 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCND1P24385 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCND1P24385 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCND1P24385 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCND1P24385 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCND1P24385 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCND1P24385 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCND1P24385 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCND1P24385 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCND1P24385 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCND1P24385 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCND1P24385 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCND1P24385 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCND1P24385 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCND1P24385 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCND1P24385 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCND1P24385 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCND1P24385 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCND1P24385 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCND1P24385 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCND1P24385 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCND1P24385 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCND1P24385 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCND1P24385 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCND1P24385 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCND1P24385 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCND1P24385 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCND1P24385 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCND1P24385 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCND1P24385 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCND1P24385 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCND1P24385 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCND1P24385 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCND1P24385 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCND1P24385 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCND1P24385 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCND1P24385 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCND1P24385 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCND1P24385 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms