Protein–RNA interactions for Protein: P24347

MMP11, Stromelysin-3, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP11P24347 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MMP11P24347 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MMP11P24347 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MMP11P24347 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MMP11P24347 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MMP11P24347 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MMP11P24347 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MMP11P24347 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MMP11P24347 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MMP11P24347 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MMP11P24347 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MMP11P24347 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MMP11P24347 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MMP11P24347 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MMP11P24347 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MMP11P24347 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MMP11P24347 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MMP11P24347 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MMP11P24347 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MMP11P24347 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MMP11P24347 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MMP11P24347 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MMP11P24347 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MMP11P24347 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MMP11P24347 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MMP11P24347 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MMP11P24347 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MMP11P24347 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MMP11P24347 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MMP11P24347 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MMP11P24347 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MMP11P24347 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MMP11P24347 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MMP11P24347 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MMP11P24347 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MMP11P24347 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MMP11P24347 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MMP11P24347 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MMP11P24347 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MMP11P24347 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MMP11P24347 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MMP11P24347 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MMP11P24347 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MMP11P24347 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MMP11P24347 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MMP11P24347 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MMP11P24347 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MMP11P24347 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MMP11P24347 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MMP11P24347 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MMP11P24347 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MMP11P24347 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MMP11P24347 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MMP11P24347 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MMP11P24347 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MMP11P24347 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MMP11P24347 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MMP11P24347 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MMP11P24347 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MMP11P24347 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MMP11P24347 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MMP11P24347 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MMP11P24347 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MMP11P24347 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MMP11P24347 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MMP11P24347 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MMP11P24347 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MMP11P24347 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MMP11P24347 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MMP11P24347 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MMP11P24347 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MMP11P24347 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MMP11P24347 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MMP11P24347 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MMP11P24347 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MMP11P24347 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MMP11P24347 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MMP11P24347 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MMP11P24347 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MMP11P24347 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MMP11P24347 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MMP11P24347 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MMP11P24347 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MMP11P24347 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MMP11P24347 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MMP11P24347 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MMP11P24347 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MMP11P24347 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MMP11P24347 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MMP11P24347 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MMP11P24347 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MMP11P24347 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MMP11P24347 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MMP11P24347 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MMP11P24347 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MMP11P24347 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MMP11P24347 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MMP11P24347 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MMP11P24347 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MMP11P24347 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms