Protein–RNA interactions for Protein: P22362

CCL1, C-C motif chemokine 1, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL1P22362 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL1P22362 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL1P22362 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL1P22362 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL1P22362 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL1P22362 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL1P22362 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL1P22362 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL1P22362 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL1P22362 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL1P22362 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL1P22362 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL1P22362 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL1P22362 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL1P22362 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL1P22362 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL1P22362 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL1P22362 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL1P22362 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL1P22362 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL1P22362 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL1P22362 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL1P22362 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL1P22362 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL1P22362 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL1P22362 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL1P22362 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL1P22362 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL1P22362 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL1P22362 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL1P22362 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL1P22362 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL1P22362 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL1P22362 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL1P22362 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL1P22362 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL1P22362 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL1P22362 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL1P22362 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL1P22362 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL1P22362 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL1P22362 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL1P22362 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL1P22362 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL1P22362 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL1P22362 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL1P22362 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL1P22362 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL1P22362 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL1P22362 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL1P22362 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL1P22362 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL1P22362 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL1P22362 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL1P22362 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL1P22362 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL1P22362 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL1P22362 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL1P22362 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL1P22362 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL1P22362 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL1P22362 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL1P22362 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL1P22362 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL1P22362 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL1P22362 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL1P22362 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL1P22362 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL1P22362 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL1P22362 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL1P22362 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL1P22362 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL1P22362 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL1P22362 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL1P22362 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL1P22362 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL1P22362 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL1P22362 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL1P22362 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL1P22362 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL1P22362 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL1P22362 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL1P22362 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL1P22362 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL1P22362 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL1P22362 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL1P22362 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL1P22362 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL1P22362 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL1P22362 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL1P22362 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL1P22362 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL1P22362 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL1P22362 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL1P22362 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL1P22362 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL1P22362 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL1P22362 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL1P22362 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL1P22362 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms