Protein–RNA interactions for Protein: P20851

C4BPB, C4b-binding protein beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BPBP20851 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms