Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms