Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms