Protein–RNA interactions for Protein: P17948

FLT1, Vascular endothelial growth factor receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT1P17948 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FLT1P17948 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FLT1P17948 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FLT1P17948 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
FLT1P17948 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FLT1P17948 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FLT1P17948 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FLT1P17948 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FLT1P17948 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FLT1P17948 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FLT1P17948 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FLT1P17948 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FLT1P17948 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FLT1P17948 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FLT1P17948 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FLT1P17948 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FLT1P17948 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FLT1P17948 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FLT1P17948 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FLT1P17948 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
FLT1P17948 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FLT1P17948 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FLT1P17948 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FLT1P17948 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FLT1P17948 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FLT1P17948 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
FLT1P17948 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FLT1P17948 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
FLT1P17948 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FLT1P17948 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FLT1P17948 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FLT1P17948 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FLT1P17948 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FLT1P17948 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FLT1P17948 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FLT1P17948 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FLT1P17948 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FLT1P17948 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FLT1P17948 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FLT1P17948 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FLT1P17948 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FLT1P17948 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FLT1P17948 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FLT1P17948 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FLT1P17948 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FLT1P17948 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FLT1P17948 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FLT1P17948 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FLT1P17948 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FLT1P17948 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FLT1P17948 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FLT1P17948 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FLT1P17948 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FLT1P17948 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FLT1P17948 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FLT1P17948 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FLT1P17948 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FLT1P17948 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
FLT1P17948 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FLT1P17948 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FLT1P17948 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FLT1P17948 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FLT1P17948 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FLT1P17948 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FLT1P17948 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FLT1P17948 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FLT1P17948 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FLT1P17948 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FLT1P17948 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FLT1P17948 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
FLT1P17948 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FLT1P17948 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FLT1P17948 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FLT1P17948 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FLT1P17948 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FLT1P17948 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FLT1P17948 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FLT1P17948 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
FLT1P17948 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
FLT1P17948 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FLT1P17948 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FLT1P17948 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FLT1P17948 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FLT1P17948 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FLT1P17948 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FLT1P17948 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FLT1P17948 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FLT1P17948 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FLT1P17948 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FLT1P17948 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FLT1P17948 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FLT1P17948 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FLT1P17948 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FLT1P17948 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FLT1P17948 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FLT1P17948 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
FLT1P17948 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FLT1P17948 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FLT1P17948 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
FLT1P17948 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms