Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms