Protein–RNA interactions for Protein: P17036

ZNF3, Zinc finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF3P17036 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms