Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VEGFAP15692 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms