Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms