Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXB3P14651 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXB3P14651 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXB3P14651 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXB3P14651 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXB3P14651 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXB3P14651 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXB3P14651 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXB3P14651 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXB3P14651 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXB3P14651 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXB3P14651 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
HOXB3P14651 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
HOXB3P14651 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HOXB3P14651 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
HOXB3P14651 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXB3P14651 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXB3P14651 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXB3P14651 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXB3P14651 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXB3P14651 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXB3P14651 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXB3P14651 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXB3P14651 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXB3P14651 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXB3P14651 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXB3P14651 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXB3P14651 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXB3P14651 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXB3P14651 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXB3P14651 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXB3P14651 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXB3P14651 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXB3P14651 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXB3P14651 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXB3P14651 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXB3P14651 AC009269.5-201ENST00000557800 755 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXB3P14651 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXB3P14651 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXB3P14651 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXB3P14651 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXB3P14651 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXB3P14651 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXB3P14651 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXB3P14651 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXB3P14651 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXB3P14651 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXB3P14651 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXB3P14651 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXB3P14651 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXB3P14651 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXB3P14651 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXB3P14651 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXB3P14651 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXB3P14651 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXB3P14651 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXB3P14651 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXB3P14651 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXB3P14651 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXB3P14651 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXB3P14651 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXB3P14651 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXB3P14651 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXB3P14651 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXB3P14651 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXB3P14651 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXB3P14651 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXB3P14651 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXB3P14651 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXB3P14651 AL365223.1-201ENST00000574864 1297 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXB3P14651 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXB3P14651 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXB3P14651 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXB3P14651 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXB3P14651 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXB3P14651 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXB3P14651 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXB3P14651 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXB3P14651 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXB3P14651 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXB3P14651 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXB3P14651 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXB3P14651 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXB3P14651 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXB3P14651 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXB3P14651 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXB3P14651 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXB3P14651 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXB3P14651 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXB3P14651 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXB3P14651 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXB3P14651 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXB3P14651 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXB3P14651 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXB3P14651 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXB3P14651 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXB3P14651 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXB3P14651 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXB3P14651 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXB3P14651 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms