Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL2P13500 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL2P13500 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL2P13500 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL2P13500 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL2P13500 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL2P13500 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL2P13500 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL2P13500 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL2P13500 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL2P13500 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL2P13500 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL2P13500 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL2P13500 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL2P13500 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL2P13500 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL2P13500 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL2P13500 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL2P13500 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL2P13500 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL2P13500 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL2P13500 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL2P13500 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL2P13500 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL2P13500 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL2P13500 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL2P13500 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL2P13500 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL2P13500 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL2P13500 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL2P13500 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL2P13500 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL2P13500 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL2P13500 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL2P13500 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL2P13500 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL2P13500 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL2P13500 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL2P13500 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL2P13500 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL2P13500 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL2P13500 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL2P13500 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL2P13500 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL2P13500 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL2P13500 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL2P13500 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL2P13500 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL2P13500 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL2P13500 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL2P13500 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL2P13500 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL2P13500 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL2P13500 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL2P13500 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL2P13500 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL2P13500 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL2P13500 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCL2P13500 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCL2P13500 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCL2P13500 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCL2P13500 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCL2P13500 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCL2P13500 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCL2P13500 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCL2P13500 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL2P13500 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL2P13500 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL2P13500 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL2P13500 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL2P13500 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL2P13500 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL2P13500 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL2P13500 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL2P13500 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL2P13500 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL2P13500 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL2P13500 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL2P13500 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL2P13500 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL2P13500 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL2P13500 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL2P13500 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL2P13500 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL2P13500 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL2P13500 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL2P13500 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL2P13500 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL2P13500 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL2P13500 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL2P13500 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL2P13500 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL2P13500 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL2P13500 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL2P13500 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL2P13500 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL2P13500 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL2P13500 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL2P13500 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL2P13500 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms