Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms