Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RGPD1P0DJD0 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms