Protein–RNA interactions for Protein: P0CJ79

ZNF888, Zinc finger protein 888, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF888P0CJ79 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms