Protein–RNA interactions for Protein: P0C7I6

CCDC159, Coiled-coil domain-containing protein 159, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC159P0C7I6 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC159P0C7I6 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms