Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C4AP0C0L4 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C4AP0C0L4 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C4AP0C0L4 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
C4AP0C0L4 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C4AP0C0L4 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C4AP0C0L4 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms