Protein–RNA interactions for Protein: P02776

PF4, Platelet factor 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4P02776 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PF4P02776 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PF4P02776 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PF4P02776 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PF4P02776 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PF4P02776 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PF4P02776 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PF4P02776 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PF4P02776 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PF4P02776 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PF4P02776 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PF4P02776 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PF4P02776 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PF4P02776 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PF4P02776 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PF4P02776 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
PF4P02776 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PF4P02776 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PF4P02776 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PF4P02776 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PF4P02776 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PF4P02776 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PF4P02776 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PF4P02776 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PF4P02776 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PF4P02776 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PF4P02776 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PF4P02776 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PF4P02776 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PF4P02776 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PF4P02776 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PF4P02776 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PF4P02776 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PF4P02776 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PF4P02776 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PF4P02776 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PF4P02776 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PF4P02776 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PF4P02776 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PF4P02776 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PF4P02776 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PF4P02776 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PF4P02776 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PF4P02776 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PF4P02776 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PF4P02776 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PF4P02776 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PF4P02776 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PF4P02776 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PF4P02776 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PF4P02776 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PF4P02776 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PF4P02776 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PF4P02776 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PF4P02776 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PF4P02776 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PF4P02776 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PF4P02776 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PF4P02776 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PF4P02776 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PF4P02776 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PF4P02776 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PF4P02776 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PF4P02776 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PF4P02776 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PF4P02776 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PF4P02776 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PF4P02776 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PF4P02776 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PF4P02776 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PF4P02776 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PF4P02776 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PF4P02776 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PF4P02776 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PF4P02776 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PF4P02776 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PF4P02776 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PF4P02776 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PF4P02776 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PF4P02776 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PF4P02776 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PF4P02776 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PF4P02776 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PF4P02776 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PF4P02776 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PF4P02776 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PF4P02776 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PF4P02776 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PF4P02776 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PF4P02776 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PF4P02776 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PF4P02776 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PF4P02776 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PF4P02776 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PF4P02776 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PF4P02776 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PF4P02776 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PF4P02776 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PF4P02776 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PF4P02776 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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