Protein–RNA interactions for Protein: P01857

IGHG1, Immunoglobulin heavy constant gamma 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHG1P01857 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms