Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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ZBED1O96006 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
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ZBED1O96006 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
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