Protein–RNA interactions for Protein: O94966

USP19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19O94966 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP19O94966 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP19O94966 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP19O94966 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP19O94966 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP19O94966 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP19O94966 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP19O94966 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP19O94966 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP19O94966 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP19O94966 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP19O94966 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP19O94966 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP19O94966 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP19O94966 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP19O94966 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP19O94966 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP19O94966 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
USP19O94966 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
USP19O94966 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP19O94966 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP19O94966 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP19O94966 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP19O94966 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP19O94966 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP19O94966 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP19O94966 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP19O94966 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP19O94966 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP19O94966 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP19O94966 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP19O94966 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP19O94966 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP19O94966 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
USP19O94966 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP19O94966 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP19O94966 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP19O94966 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP19O94966 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
USP19O94966 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP19O94966 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP19O94966 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP19O94966 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP19O94966 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP19O94966 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP19O94966 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP19O94966 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP19O94966 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP19O94966 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP19O94966 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP19O94966 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP19O94966 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP19O94966 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP19O94966 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP19O94966 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP19O94966 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP19O94966 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP19O94966 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP19O94966 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP19O94966 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP19O94966 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP19O94966 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP19O94966 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP19O94966 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP19O94966 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP19O94966 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP19O94966 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
USP19O94966 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP19O94966 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP19O94966 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP19O94966 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP19O94966 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP19O94966 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP19O94966 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP19O94966 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP19O94966 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP19O94966 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
USP19O94966 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
USP19O94966 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP19O94966 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
USP19O94966 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP19O94966 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP19O94966 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
USP19O94966 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP19O94966 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
USP19O94966 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP19O94966 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
USP19O94966 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP19O94966 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP19O94966 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP19O94966 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
USP19O94966 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP19O94966 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP19O94966 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP19O94966 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP19O94966 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP19O94966 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP19O94966 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
USP19O94966 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP19O94966 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms