Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRMUO75648 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRMUO75648 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRMUO75648 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRMUO75648 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRMUO75648 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRMUO75648 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRMUO75648 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRMUO75648 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRMUO75648 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRMUO75648 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRMUO75648 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
TRMUO75648 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRMUO75648 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRMUO75648 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRMUO75648 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRMUO75648 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRMUO75648 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRMUO75648 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRMUO75648 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRMUO75648 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRMUO75648 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRMUO75648 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRMUO75648 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRMUO75648 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRMUO75648 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRMUO75648 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRMUO75648 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRMUO75648 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRMUO75648 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRMUO75648 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRMUO75648 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRMUO75648 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRMUO75648 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRMUO75648 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRMUO75648 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRMUO75648 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRMUO75648 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRMUO75648 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRMUO75648 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRMUO75648 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRMUO75648 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRMUO75648 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRMUO75648 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRMUO75648 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRMUO75648 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRMUO75648 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRMUO75648 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TRMUO75648 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRMUO75648 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRMUO75648 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
TRMUO75648 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRMUO75648 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRMUO75648 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRMUO75648 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRMUO75648 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TRMUO75648 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
TRMUO75648 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRMUO75648 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRMUO75648 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRMUO75648 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRMUO75648 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRMUO75648 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRMUO75648 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRMUO75648 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRMUO75648 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRMUO75648 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRMUO75648 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRMUO75648 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TRMUO75648 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRMUO75648 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRMUO75648 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRMUO75648 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRMUO75648 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRMUO75648 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRMUO75648 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRMUO75648 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRMUO75648 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRMUO75648 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRMUO75648 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRMUO75648 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRMUO75648 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRMUO75648 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRMUO75648 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRMUO75648 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRMUO75648 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRMUO75648 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRMUO75648 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRMUO75648 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRMUO75648 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRMUO75648 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRMUO75648 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRMUO75648 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRMUO75648 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRMUO75648 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRMUO75648 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRMUO75648 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRMUO75648 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRMUO75648 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRMUO75648 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms