Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms